Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn4E9PX29 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn4E9PX29 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms