Protein–RNA interactions for Protein: E9PW05

Zfp54, Zinc finger protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp54E9PW05 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp54E9PW05 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp54E9PW05 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms