Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc144bE9PVZ3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms