Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam53aE9PV82 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam53aE9PV82 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms