Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms