Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syde2E9PUP1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms