Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms