Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clca3bE9PUL3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clca3bE9PUL3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms