Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Soga1E1U8D0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms