Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930595D18RikD3Z642 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930595D18RikD3Z642 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930595D18RikD3Z642 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930595D18RikD3Z642 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930595D18RikD3Z642 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930595D18RikD3Z642 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms