Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5934D3Z4U6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms