Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms