Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc6D3YZP9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc6D3YZP9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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