Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rexo5D3YW29 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Rexo5D3YW29 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rexo5D3YW29 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms