Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ptprz1B9EKR1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprz1B9EKR1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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