Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cttnbp2B9EJA2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cttnbp2B9EJA2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms