Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms