Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Abcc8B2RUS7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Abcc8B2RUS7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Abcc8B2RUS7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms