Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf3B2RUQ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usf3B2RUQ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usf3B2RUQ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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