Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apol7aB2RT54 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apol7aB2RT54 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms