Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ythdc2B2RR83 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc2B2RR83 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms