Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uhrf1bp1B2KF50 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms