Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brpf3B2KF05 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brpf3B2KF05 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms