Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn34b1B1AZQ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn34b1B1AZQ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b1B1AZQ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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