Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Skint8A7XV07 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skint8A7XV07 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms