Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
H2-M5A7VMS3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
H2-M5A7VMS3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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