Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rtf1A2AQ19 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rtf1A2AQ19 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms