Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtcflA2APF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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