Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cavin4A2AMM0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cavin4A2AMM0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms