Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SetxA2AKX3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms