Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms