Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700023F06RikA2AB62 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms