Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pramef6A2A8M8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pramef6A2A8M8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pramef6A2A8M8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pramef6A2A8M8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pramef6A2A8M8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramef6A2A8M8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms