Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkd2l1A2A259 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms