Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms