Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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