Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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