Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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TRIM28Q13263 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TRIM28Q13263 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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TRIM28Q13263 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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TRIM28Q13263 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
TRIM28Q13263 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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