Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt6bQ9Z331 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt6bQ9Z331 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms