Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gria4Q9Z2W8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gria4Q9Z2W8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms