Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms