Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Hdac6Q9Z2V5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac6Q9Z2V5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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