Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Robo3Q9Z2I4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Robo3Q9Z2I4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms