Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mbd3Q9Z2D8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms