Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rps6ka4Q9Z2B9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms