Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn7Q9Z261 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms