Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uso1Q9Z1Z0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uso1Q9Z1Z0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms