Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ilf3Q9Z1X4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms