Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clic1Q9Z1Q5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms