Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf1Q9Z1B8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf1Q9Z1B8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms